UPD2
В общем в чем проблема понял. Первый уровень пройден. Приступаю к полноценному переносу.
З.Ы. Может это и глупость. Может это и так все знают а я дурак методом тыка это все вычислял, но как я и думал косяк был в концовке VAG'а.
При конвертации концовка файла принимает такой вид:
При вставке в файл со звуком меняем выделенную выше строчку на последнюю строку из оригинального VAG файла.
И эту же строчку после добавленных нулей.
У меня только так получилось с этим справится. Прошу прощения если написал глупость и то что такой метод выглядит немного кустарно. Может просто кому еще пригодится. Так что просьба особо не пинать если все таки сморозил глупость.

