У меня файлы в Foobar 2000 открыты, поэтому я вижу какое время проставлено и сколько нужно вычесть, чтобы подогнать. В начале идёт at3, потом wav:
С подрезаем тишины много гемора, так как в основном все утилиты режут в начале и в конце, а середину не трогают, поэтому для удобства я использую Awave Studio.